预包装食品经营备案申请流程一般包括以下步骤：

登录相关网站：首先，需要登录国家市场监督管理总局食品安全监管信息系统或所在地的省市食品药品监督管理局的网站。
注册账号：如果是首次办理食品销售备案，需要注册账号并填写相关的信息。
选择备案事项：登录成功后，根据需求选择进行食品销售备案。
填写备案信息：根据系统的指引，按照要求填写相关备案信息，如企业名称、地址、法定代表人等。
上传材料：在填写完备案信息后，需要将相关的材料扫描后上传至系统。这些材料可能包括营业执照、食品经营许可证等相关证照原件及复印件，食品生产者需提供生产场所的租赁合同、房产证等证明材料，食品安全管理员的资质证明材料，以及其他需要提供的证明材料。
缴纳费用：在完成备案信息和材料上传后，需要按照系统的要求进行费用缴纳。具体费用可能因地区而异。
提交备案申请：完成所有步骤后，确认无误后提交备案申请。
审核与公示：根据不同地区的规定，备案申请可能需要经过食品药品监督管理局的审核，并在规定的时间内进行公示。审核通过后，将会发放预包装食品销售备案证书或备案号。
请注意，以上流程可能会因地区和具体情况而有所不同。建议在申请前仔细阅读当地食品药品监督管理局的相关规定和要求，并咨询相关部门或专业律师以获取准确信息。

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